主页 > 科技服务 > 微生物基因组测序 > 16S/18S/ITS扩增子测序
扩增子测序是对特定长度的PCR产物或者捕获的片段进行测序,目前主要是应用高通量测序技术对特定环境中特定遗传物质进行测序,如原核生物16S rDNA/rRNA,真核生物18S rDNA/rRNA或者rDNA-ITS,这些特定的遗传物质都包括进化保守性及进化可变区,因此通过对这些可变区的测序和比对分析,可以克服培养技术的缺点,获得不能分离培养的物种信息,从而全面精确地探究并揭示不同环境中物种的多样性。根据研究目的不同可细分为如下几个产品类型:
系统性红斑狼疮患者龈下菌群变化及与牙周状况的相关性
Subgingival microbiota dysbiosis in systemic lupus erythematosus: association with periodontal status
慢性全身炎症性疾病影响龈下微生物群落和临床的牙周状态,牙龈炎是由龈下生物膜与宿主免疫反应之间的相互作用所致。本研究选取52名系统性红斑狼疮(SLE)患者和52名健康个体,对龈下牙斑DNA进行16S rDNA测序,旨在探究SLE与龈下微生物的关系。
本研究主要结果如下:
1.对照组中患有牙周炎人群口腔菌群多样性要显著高于未患有牙周炎的人群。
2.对照组人群健康龈下部位相比,SLE患者健康龈下部位的Lachnospiraceae丰度显著提高,而Prevotella oulorum、Prevotella pleuritidis、Pseudomonas spp、Treponema maltophilum等微生物的相对丰度在SLE患者牙周炎部位显著提高。
3.研究发现,在健康人群中,共有89种微生物之间存在正相关或负相关;SLE患者中,共有111种微生物之间存在互作。
4.患有牙周炎的SLE患者唾液中IL-6、IL-7和IL-33的浓度与Selenomonas、Prevotella denticola、Veilonella atypical等菌的相对丰度有关。
结果展示:
图1. 非牙周炎和牙周炎部位OTUs及分类差异
Corrêa JD, Calderaro DC, Ferreira GA, et al. Subgingival microbiota dysbiosis in systemic lupus erythematosus: association with periodontal status. Microbiome. 2017;5:34.